确定了日本人患食管癌预后相关的基因突变

创建有明 2021-09-24

东京医科齿科大学8月17日宣布，通过日本人食管鳞状细胞癌的外显子组分析，确定了与食管癌预后相关的基因及其突变。这项研究由该大学生物资源中心助理教授竹本晓特、难治性疾病研究所和基因组分析办公室教授谷本幸介教授，稻泽让治癌症主任，野田哲生的研究小组组成。研究结果在线发表在《癌症科学》上。

食管鳞状细胞癌（ESCC）是一种预后极差的疾病，在包括日本在内的亚洲国家发病率高，易发生淋巴结转移。迄今为止，结合手术切除、化学疗法、放射疗法及其治疗的多学科疗法的发展已经发展，但晚期癌症的预后仍然很差。

近年来，全面的基因组分析开始流行，食管癌的基因组异常正在被阐明。然而，DNA甲基化、基因表达分析等包括表观基因组和转录组的综合分析还不够，需要研究表观基因组和转录组异常之间的关系。

有NOTCH3基因突变的病例，有增加死亡率的趋势
首先，研究组从东京医科齿科大学医院（68例）和癌症研究所有明医院（20例）共88例ESCC切除标本和接受手术切除的正常组织中提取DNA。使用下一代测序仪进行外泌体分析，以识别基因突变和拷贝数异常。结果证实，检测到基因突变和拷贝数异常的趋势与现有报道相同。

此外，结合现有报告的分析表明，具有 NOTCH3 突变的病例往往比没有 NOTCH3 突变的病例具有更高的死亡率。

揭示癌症特异性 AEI 等分子异常
此外，对东京医科齿科大学附属医院67例进行了DNA甲基化分析，对56例进行了综合基因表达分析。综合分析包括所有外显子分析的结果，发现等位基因的表达失衡（AEI）特异发生在1,567个基因中。

这些基因中有 FAT 家族基因，在 ESCC 中经常报道其基因突变。结果，在 30%（17/56 例）中，在 FAT1 或 FAT2 基因中检测到包括 AEI 在内的遗传异常，并证实这些遗传异常倾向于相互排斥。

可能导致异常，例如 AEI 基因和基因功能下降
这项研究通过对表观基因组转录组和基因组的综合分析揭示了 ESCC 中的 AEI 谱。

带有 AEI 的基因可能会导致基因功能下降等异常。因此，未来AEI对ESCC发病机制的阐明以及对新治疗靶基因和生物标志物的探索将取得进展，个性化医疗（癌症基因组医学）将根据癌症的基因异常决定治疗策略。研究小组表示，有望向前推进。

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